Vướng mắc về thuế thu nhập doanh nghiệp 1

Kính gửi Tổng cục thuế, Công ty tôi đang thực hiện Quyết toán thuế Thu nhập doanh nghiệp năm 2019 cho Trụ sở chính và các chi nhánh phụ thuộc, phát sinh 2 vấn đề cần sự hướng dẫn của Tổng Cục thuế, rất mong nhận được sự hướng dẫn từ Tổng cục thuế. Cụ thể như sau: 1. Xác định số thuế phải nộp tại Trụ sở chính và các chi nhánh phụ thuộc: Trong năm 2019, Công ty thực hiện đăng ký chi nhánh phụ thuộc: - CHI NHÁNH 1 chính thức đi vào hoạt động năm 2020. - CHI NHÁNH 2 chính thức đi vào hoạt động và tạo ra doanh thu, lợi nhuận từ tháng 06/2019. - CHI NHÁNH 3 chính thức đi vào hoạt động và tạo ra doanh thu, lợi nhuận từ tháng 12/2019. Căn cứ theo Điều 13 Thông tư 78/2014/TT-BTC quy định về xác định xác đinh tỷ lệ chi phí nộp thuế của chi nhánh hạch toán phụ thuộc. Theo đây năm 2019, Công ty dựa vào chi phí thực tế phát sinh trong năm của từng cơ sở để tính tỷ lệ chi phí, xác định số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp cho từng chi nhánh. Tỷ lệ chi phí này được áp dụng cố định cho các năm sau. Tuy nhiên, các chi nhánh hạch toán phụ thuộc có thời gian bắt đầu đi vào hoạt động không đồng đều nên nếu dùng tỷ lệ chi phí đã tính của năm 2019 áp dụng cố định cho các năm sau đó, sẽ dẫn đến số thuế thu nhập doanh nghiệp phải nộp tính cho các chi nhánh hạch toán phụ thuộc sẽ không hợp lý? Vậy Công ty có được tính lại tỷ lệ chi phí cho năm 2020, và áp dụng cố định tỷ lệ này cho các năm sau đó được hay không? Tháng 12/2019, Chi nhánh 3 chính thức đi vào hoạt động và Báo cáo kết quả hoạt động kinh doanh của Chi nhánh không có lợi nhuận (tức Chi nhánh bị lỗ), vậy Công ty có thực hiện phân bổ số thuế phải nộp trong năm 2019 của Trụ sở chính về Chi nhánh 3 hay không? 2. Kê khai các giao dịch liên kết: Trong năm 2019, Công ty có phát sinh giao dịch liên kết với đối tượng nộp thuế thu nhập doanh nghiệp tại Việt Nam, áp dụng khác mức thuế suất thu nhập doanh nghiệp với Công ty và được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (Công ty chúng tôi không được hưởng ưu đãi thuế). Căn cứ theo điều 11, Nghị định 20/2017/NĐ-CP ngày 24 tháng 02 năm 2017 Quy định các trường hợp người nộp thuế được miễn kê khai, miễn lập Hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết, thì trường hợp của Công ty nằm trong diện phải kê khai giao dịch liên kết. Vậy mong Tổng Cục thuế giải đáp thắc mắc là: Khi thực hiện kê khai Mẫu số 01 kèm theo Nghị định trên, Công ty chỉ thực hiện kê khai giao dịch phát sinh với các bên liên kết là đối tượng nộp thuế thu nhập doanh nghiệp áp dụng không cùng mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp với Công ty, còn những giao dịch phát sinh với các bên liên kết là đối tượng nộp thuế thu nhập doanh nghiệp tại Việt Nam, áp dụng cùng mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp với Công ty sẽ không thực hiện kê khai lên mẫu 01 này hay Công ty phải thực hiện kê khai tất cả đối tượng có giao dịch liên kết (không phân biệt mức thuế suất thuế thu nhập doanh nghiệp áp dụng) Rất mong nhận được sự hướng dẫn từ Tổng Cục thuế trong thời gian sớm nhất. Xin trân trọng cảm ơn.